Анализ генома
в реальном времени
Как лаборатория «БиоГен-Альянс» сократила время секвенирования ДНК на 60% с помощью кластера Verax Data Systems.
Задача клиента
Лаборатория «БиоГен-Альянс» столкнулась с критическим ростом объема данных при переходе на полногеномное секвенирование (WGS).
Вычислительный тупик
Существующие локальные серверы обрабатывали один геном в среднем за 48 часов. Очередь из образцов превышала 300 единиц, что создавало бутылочное горлышко для клинических исследований.
Проблемы хранения
Ежедневный прирост данных составлял 50 ТБ. Ленты для холодного хранения были слишком медленны для ретроспективного анализа, а SSD-накопители быстро исчерпывали свой ресурс.
Требования к точности
Любая потеря пакетов данных при передаче в распределенную сеть приводила к необходимости повторного сканирования образцов, что удваивало затраты на реагенты.
Гибридная HPC-архитектура
Мы развернули специализированный кластер на базе архитектуры Verax Scale-Out, оптимизированный под алгоритмы выравнивания последовательностей (BWA-MEM).
- • Вертикальное масштабирование: 40 узлов с процессорами AMD EPYC и 2 ТБ оперативной памяти на ноду для работы с большими графами.
- • Высокоскоростная сеть: Интеграция InfiniBand NDR для минимизации задержек между узлами кластера.
- • Интеграция ПО: Предварительная настройка стека BioLinux с библиотеками GATK и Samtools.
Результаты внедрения
Эффективность клинических исследований «БиоГен-Альянс» выросла в разы уже в первый квартал эксплуатации системы.
18 ч
Новое время
секвенирования
62%
Снижение
Опекс
0.00%
Потеря
данных
24/7
Автоматизация
процессов
Ваш проект заслуживает точности
Не позволяйте аппаратным ограничениям тормозить научные открытия. Мы поможем спроектировать инфраструктуру под ваши специфические задачи.